สถานีวิจัยและฝึกอบรมเกษตรอินทรีย์ (บ่อทอง) มีภาระหน้าที่รับผิดชอบในการดำเนินงานด้านการเกษตร ทางด้านพืชไร่ พืชสวน การจำหน่ายสินค้าทางการเกษตรที่ผลิตได้จากสถานีวิจัยฯ และสถานีวิจัยฯ นอกจากการดำเนินการดังกล่าวแล้ว สถานีวิจัยฯ ยังมีการดำเนินการในส่วนของการดูแลพื้นที่บริเวณต่างๆ โดยรอบ ไม่ให้รกร้างและ มีทัศนียภาพที่สวยงาม