สำนักงานยุทธศาสตร์เป็นหน่วยงานที่ถูกจัดตั้งขึ้นภายใต้สำนักงานอธิการบดี และเป็นหน่วยงานที่ตอบสนองต่อนโยบายและยุทธศาสตร์ของมหาวิทยาลัย จึงมีมติมหาวิทยาลัยให้จัดตั้งสำนักงานยุทธศาสตร์เมื่อวันที่ 22 มีนาคม 2564 ซึ่งมีภาระหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับการจัดทำแผนพัฒนาของหน่วยงานให้สอดคล้องกับแผนพัฒนามหาวิทยาลัย ดำเนินงานให้เป็นไปตามยุทธศาสตร์ของมหาวิทยาลัยและประเทศ บริหารจัดการสินทรัพย์และรายได้ ส่งเสริมภาพลักษณ์องค์กร จัดทำแผนและดำเนินการด้านทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรม ส่งเสริมสนับสนุนการดำเนินงานตามพันธกิจด้านทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรมและความเป็นไทย ประสานงานเขตพัฒนาพิเศษภาคตะวันออก (EEC) บูรณาการด้านงานวิจัย ส่งเสริมและพัฒนานวัตกรรมและซอฟต์แวร์ ERP Solution Service Innovative Agricultural Services Innovative Health Care Services นวัตกรรมสมุนไพรทางเลือก บริหารจัดการหอพัก บริหารงานฟาร์ม ให้มีประสิทธิภาพและเกิดประสิทธิผลอย่างคุ้มค่า กำหนดนโยบายและแนวทางในการดำเนินงานในส่วนที่เกี่ยวข้องเพื่อให้หน่วยงานภายในมหาวิทยาลัยมีมาตรฐานและแนวทางในการยึดถือปฏิบัติเป็นไปในทิศทางเดียวกัน